Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl28Q9JIL2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms