Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pus3Q9JI38 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pus3Q9JI38 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms