Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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