Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Erg28Q9ERY9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Erg28Q9ERY9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms