Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cxcr6Q9EQ16 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms