Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms