Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SyncQ9EPM5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SyncQ9EPM5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms