Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms