Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms