Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

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Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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