Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcg8Q9DBM0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms