Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pop5Q9DB28 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Pop5Q9DB28 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Pop5Q9DB28 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Pop5Q9DB28 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Pop5Q9DB28 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Pop5Q9DB28 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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