Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138rt1Q9D9M9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms