Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Fip1l1Q9D824 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms