Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms