Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm5Q9D6G9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms