Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms