Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc39Q9D5Y1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms