Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms