Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PudpQ9D5U5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PudpQ9D5U5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms