Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm3404Q9D506 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm3404Q9D506 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm3404Q9D506 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm3404Q9D506 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm3404Q9D506 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm3404Q9D506 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm3404Q9D506 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm3404Q9D506 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Gm3404Q9D506 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3404Q9D506 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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