Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms