Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms