Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms