Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms