Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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