Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmbr1lQ9D1E5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms