Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syf2Q9D198 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms