Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tmem88Q9D0N8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tmem88Q9D0N8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tmem88Q9D0N8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmem88Q9D0N8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmem88Q9D0N8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmem88Q9D0N8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem88Q9D0N8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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