Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms