Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ndc80Q9D0F1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndc80Q9D0F1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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