Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms