Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms