Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mis12Q9CY25 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms