Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smc1aQ9CU62 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smc1aQ9CU62 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smc1aQ9CU62 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smc1aQ9CU62 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms