Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms