Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ykt6Q9CQW1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms