Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccer1Q9CQL2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms