Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzk1ip1Q9CQH0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms