Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700129C05RikQ9CQ77 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms