Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp2Q9CQ73 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp2Q9CQ73 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms