Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpa3Q9CQ71 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpa3Q9CQ71 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms