Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GpnmbQ99P91 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms