Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg3Q99P81 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcg3Q99P81 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcg3Q99P81 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcg3Q99P81 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcg3Q99P81 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcg3Q99P81 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcg3Q99P81 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg3Q99P81 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms