Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms