Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms