Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp16Q99LG0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms