Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms