Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed9Q99KF1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed9Q99KF1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed9Q99KF1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed9Q99KF1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed9Q99KF1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed9Q99KF1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed9Q99KF1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed9Q99KF1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed9Q99KF1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed9Q99KF1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed9Q99KF1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed9Q99KF1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed9Q99KF1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed9Q99KF1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed9Q99KF1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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