Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms